English Intern
IMIB - INSTITUT FÜR MOLEKULARE INFEKTIONSBIOLOGIE

Prof. Dr. Emmanuel Saliba

 

       FORSCHUNGSPROJEKTE

  • Einzell-Zell RNA Seqenzierung
     
  • Transkriptom Analyse in in vivo Modellen
     

Forschung

Pathogene Organismen haben erstaunliche Fähigkeiten Wirtszellen zu unterwandern damit sie überleben oder sich vermehren können. Die Charakterisierung und das Verständnis infizierter Zellen auf Einzelzellebene mit Hilfe genomweiter Transkriptomanalysen in Kombination mit in-vivo-Modellen und Gewebezüchtung sind ein wirksamer Ansatz, um die Heterogenität des Infektionsprozesses zu verstehen. Diese Ansätze haben auch das Potenzial, die Mikroumgebung zwischen Wirt und Erreger zu entschlüsseln und letztlich die Auswirkungen einzelner Infektionsherde auf den Krankheitsverlauf mit einer noch nie dagewesenen Auflösung zu klären. Unsere Modellorganismen sind Salmonella Typhimurium und Atemwegsviren. Auf der Grundlage der Einzelzelltranskriptomik entwickeln wir quantitative Methoden, um die physiologischen Merkmale jedes einzelnen Pathogens in Raum und Zeit in Verbindung mit seinem Wirt zu verfolgen.  Ein weiterer Schritt ist  die dreidimensionale Rekonstruktion der Umgebung von Infektionsherden.

Wendisch D, Dietrich O, Mari T, von Stillfried S, Ibarra IL, Mittermaier M, ..., Ochs M, Eils R, Müller-Redetzky H, Hauser AE, Luecken MD, Theis FJ, Conrad C, Wolff T, Boor P, Selbach M, Saliba AE#, Sander LE# (2021)
SARS-CoV-2 infection triggers profibrotic macrophage responses and lung fibrosis
Cell 184(26):6243-6261.e27
#corresponding authors

Imdahl F, Vafadarnejad E, Homberger, C, Saliba AE#, Vogel J# (2020)
Single-cell RNA-sequencing reports growth-condition-specific global trans-criptomes of individual bacteria
Nature Microbiology 5(10):1202-1206
#corresponding authors

Schulte-Schrepping J, Reusch N, Paclik D, Baßler K, ..., Schultze JL, Aschenbrenner AC, Li Y, Nattermann J, Sawitzki B, Saliba AE, Sander LE, Deutsche COVID-19 OMICS Initiative (DeCOI) (2020)
Severe COVID-19 is marked by a dysregulated myeloid cell compartment
Cell 182(6):1419-1440.e23
 

Publikationen chronologisch (pdf)

Dr. Antoine-Emmanuel Saliba

Gruppenleiter
AG Saliba
Telefon: +49 931 31 81341

Tristan Beste

Doktorand
AG Saliba

Ariane Binder

Doktorandin
AG Saliba

Laura Checchino

Doktorandin
AG Saliba

Lisa Chiggiato

Doktorandin
AG Saliba

Chia-Ling Chou

Doktorandin
AG Saliba

Nina Difabion

Technische/r Assistent/in
AG Saliba
Telefon: +49 931 31 89351

Anastasiya Grinko

Doktorandin
AG Saliba

Alexander Leipold

Doktorand
AG Saliba
Telefon: +49 931 31 88471

Tobias Krammer

Doktorand
AG Saliba
Telefon: +49 931 31 84392

Christophe Toussaint

Doktorand
AG Saliba
Telefon: +49 931 31 86071