Prof. Dr. Cynthia Sharma
FORSCHUNGSPROJEKTE
- RNA-basierte Regulation in bakteriellen Krankheitserregern
- Identifizierung und Charakterisierung von kleinen Proteinen in Bakterien
- Mechanismen und Funktionen von prokaryotischen CRISPR-Cas-Systemen
Modellorganismen
Forschung
In unserer Arbeitsgruppe erforschen wir die Mechanismen und Funktionen der Genregulation des Magenkeims Helicobacter pylori und des verwandten Lebensmittelkeims Campylobacter jejuni. Insbesondere fokussieren wir uns auf die posttranskriptionelle Regulation der Stressantwort und Virulenzkontrolle durch kleine regulatorische RNAs (sRNAs) und assoziierte RNA-bindende Proteine (RBPs). Wir entwickeln und verwenden verschiedene Hochdurchsatzsequenzierungs-ansätze für globale Transkriptomstudien und die Analyse von RNA-Protein-Komplexen sowie Translatomanalysen zur Identifizierung kleiner Proteine. Mittels dreidimensionaler (3D) Infektionsmodelle, die auf der Technologie der Gewebezüchtung basieren, untersuchen wir die Rolle von sRNAs, kleinen Proteinen und RBPs bei der Pathogenese dieser weit verbreiteten menschlichen Krankheitserreger.
Jiao C, Sharma S, Dugar G, Peeck NL, Bischler T, Wimmer F, Yu Y, Barquist L, Schoen C, Kurzai C, Sharma CM*, Beisel CL* (2021) * Corresponding authors
Non-canonical crRNAs derived from host transcripts enable multiplexable RNA detection by Cas9
Science 372(6545):941-948
Pernitzsch SR, Alzheimer M, Bremer BU, Robbe-Saule M, de Reuse H, Sharma CM (2021)
Small RNA mediated gradual control of lipopolysaccharide biosynthesis control affects antibiotic resistance in Helicobacter pylori
Nature Communications 12(1):4433
Eisenbart SK, Alzheimer M, Pernitzsch SR, Dietrich S, Stahl S, Sharma CM (2020)
A repeat-associated small RNA controls the major virulence factors of Helicobacter pylori
Molecular Cell 80(2):210-226
Alzheimer M, Svensson SL, König F, Schweinlin M, Metzger M, Walles H, Sharma CM (2020)
A three-dimensional intestinal tissue model reveals factors and small regulatory RNAs important for colonization with Campylobacter jejuni
PLoS Pathogens 16(2):e1008304
Dugar G, Leenay RT, Eisenbart SK, Bischler T, Aul BU, Beisel CL, Sharma CM (2018)
CRISPR RNA-Dependent Binding and Cleavage of Endogenous RNAs by the Campylobacter jejuni Cas9
Molecular Cell 69(5):893-905
Prof. Dr. Cynthia Sharma
Dr. Mona Alzheimer
Thea Bruchhardt
Dr. Davide Figini
Dr. Elisabetta Fiore
Christine Hambrecht-Schleyer
Evelyne Hopp
Philipp Kible
Dr. Salini Konikkat
Johannes Kullmann
Manasa Narayan
Dr. Stefan Oberlin
Shounok Panja
Dr. Sahil Sharma
Dr. Annamaria Zannoni
