Prof. Dr. A. Westermann
FORSCHUNGSPROJEKTE
- RNA-Biologie von anaeroben
Darmkommensalen
- Wirt-Mikroben-Interaktionsstudien
- Artenübergreifende RNA-seq-Technologien
- Hypoxische Gewebemodelle zur
bakteriellen Kolonisation
MODEL ORGANISMS
Forschung
Der menschliche Darmtrakt bietet eine attraktive Umgebung für nützliche, aber auch für krankheitserregende Bakterien. Die nützlichen Bakterien helfen dabei, Nahrung zu verdauen, und bieten darüber hinaus zahlreiche gesundheitliche Vorteile. Krankheitserreger hingegen nutzen den Darm als Angriffspunkt für eine Infektion. Beide Gruppen beeinflussen sowohl sich gegenseitig, als auch ihren gemeinsamen Wirt, uns Menschen. Das Verständnis der diesen Wechselwirkungen zugrunde liegenden regulatorischen Prozesse kann zur Bekämpfung von Infektionskrankheiten beitragen. Während wir jedoch zunehmend Einblicke in proteinvermittelte Prozesse bekommen, ist die Rolle von RNA-zentrierten Mechanismen in der Kontrolle mikrobieller Interaktionen im Darm noch weitestgehend unerforscht.
Ryan D, Bornet E, Prezza G, Varshini Alampalli S, Franco de Carvalho T, Felchle H, Ebbecke T, Hayward R, Deutschbauer AM, Barquist L, Westermann AJ (2024)
An expanded transcriptome atlas for Bacteroides thetaiotaomicron reveals a small RNA that modulates tetracycline sensitivity
Nature Microbiology 9(4):1130-1144
Prezza G, Liao C, Reichardt S, Beisel CL, Westermann AJ (2024)
CRISPR-based screening of small RNA modulators of bile susceptibility in Bacteroides thetaiotaomicron
PNAS 121(6):e2311323121
Westermann AJ*,+, Vogel J*,+ (2021)
Cross-species RNA-seq for deciphering host-microbe interactions
Nature Reviews Genetics 22(6):361-378
Ryan D, Jenniches L, Reichardt S, Barquist L, Westermann AJ (2020)
A high-resolution transcriptome map identifies small RNA regulation of metabolism in the gut microbe Bacteroides thetaiotaomicron
Nature Communications 11(1):3557
Westermann AJ, Förstner KU, Amman F, Barquist L, Chao Y, Schulte LN, Müller L, Reinhardt R, Stadler PF, Vogel J (2016)
Dual RNA-seq unveils noncoding RNA functions in Salmonella-host interplay
Nature 529(7587):496-501
Jun Prof. Alexander Westermann
Elise Bornet
Taís Franco de Carvalho
Hoda Kooshapour
Gohar Mädler
Gianluca Prezza
Sarah Reichardt
Dr. Daniel Ryan
Ann Sophie Rüttiger
