Rektoren während des Deutschen Kaiserreichs (1871 - 1918)
Joseph Zahn
Wintersemester 1917/18 - Sommersemester 1918
Dogmatik und christliche Symbolik
Benno Schmidt
Wintersemester 1916/17 - Sommersemester 1917
allgemeine Pathologie und pathologische Anatomie
Ernst Mayer
Wintersemester 1915/16 - Sommersemester 1916
deutsches bürgerliches Recht, Handels- und Wechselrecht, bayerisches Landesrecht sowie deutsche Rechtsgeschichte und Kirchenrecht
Oskar Brenner
Wintersemester 1914/15 - Sommersemester 1915
deutsche Philologie
Wilhelm Wien
Wintersemester 1913/14 - Sommersemester 1914
Physik
Johannes Hehn
Wintersemester 1912/13 - Sommersemester 1913
alttestamentliche Exegese und biblisch-orientalische Sprachen
Karl Bernhard Lehmann
Wintersemester 1911/12 - Sommersemester 1912
Hygiene
Georg von Schanz
Wintersemester 1910/11 - Sommersemester 1911
Nationalökonomie, Finanzwissenschaft und Statistik
Julius Jolly
Wintersemester 1909/10 - Sommersemester 1910
Sanskrit und vergleichende Sprachwissenschaft
Franz Xaver Kiefl
Wintersemester 1908/09 - Sommersemester 1909,
Dogmatik und christliche Symbolik
Philipp Stöhr
Wintersemester 1907/08 – Sommersemester 1908
Anatomie, Histologie und Embryologie
Friedrich Oetker
Wintersemester 1906/07 – Sommersemester 1907,
Strafrecht und Strafprozessrecht sowie des Rechts der freiwilligen Gerichtsbarkeit
Theodor Boveri
Wintersemester 1905/06 – Sommersemester 1906
Zoologie und vergleichende Anatomie
Sebastian Merkle
Wintersemester 1904/05 – Sommersemester 1905
Kirchengeschichte, christliche Dogmengeschichte und christliche Archäologie
Adam Josef Kunkel
Wintersemester 1903/04 – Sommersemester 1904
Pharmakologie
Christian Meurer
Wintersemester 1902/03 – Sommersemester 1903
katholisches Kirchenrecht, Völkerrecht sowie Rechtsphilosophie und Rechtsenzyklopädie
Martin von Schanz
Wintersemester 1901/02 – Sommersemester 1902
klassische Philologie
Friedrich Philipp Abert
Wintersemester 1900/01 – Sommersemester 1901
Dogmatik und christliche Symbolik
Max Hofmeier
Sommersemester 1900
Geburtshilfe und Gynäkologie
Julius von Michel
Wintersemester 1899/1900
Augenheilkunde
Friedrich Schollmeyer
Wintersemester 1898/99 - Sommersemester 1899
Zivilprozessrecht, deutsches bürgerliches Recht und römisches Zivilrecht
Friedrich Prym
Wintersemester 1897/98 – Sommersemester 1898
Mathematik
Hermann Schell
Wintersemester 1896/97 – Sommersemester 1897
Apologetik, vergleichende Religionswissenschaft und christliche Kunstgeschichte
Wilhelm Olivier von Leube
Wintersemester 1895/96 – Sommersemester 1896
spezielle Pathologie und Therapie
Georg Schanz
Sommersemester 1895
Nationalökonomie, Finanzwissenschaft und Statistik
Karl Freiherr von Stengel
Wintersemester 1894/95
allgemeines deutsches und bayerisches Staatsrecht, Rechtsphilosophie und Völkerrecht
Wilhelm Conrad Röntgen
Wintersemester 1893/94 - Sommersemester 1894
Physik
Anton Scholz
Wintersemester 1892/93 - Sommersemester 1893
Exegese des alten testaments und der biblisch-orientalischen Sprachen
Karl Schönborn
Wintersemester 1891/92 - Sommersemester 1892
Chirurgie
Lothar Seuffert
Wintersemester 1890/91 - Sommersemester 1891
römisches Zivilrecht und Zivilprozessrecht
Matthias von Lexer
Wintersemester 1889/90 - Sommersemester 1890
deutsche Philologie
Josef Grimm
Wintersemester 1888/89 – Sommersemester 1889
neutestamentliche Exegese
Georg Eduard Rindfleisch
Wintersemester 1887/88 – Sommersemester 1888
pathologische Anatomie, allgemeine Pathologie und Geschichte der Medizin
Hugo Burckhard
Wintersemester 1886/87 – Sommersemester 1887
römisches Zivilrecht
Carl Ludwig von Urlichs
Wintersemester 1885/86 – Sommersemester 1886
klassische Philologie und Ästhetik
Heinrich Kihn
Wintersemester 1884/85 – Sommersemester 1885
Kirchenrecht, Patrologie, theologische Einleitungs-Wissenschaften und biblische Hermeneutik
Karl Gerhardt
Wintersemester 1883/84 – Sommersemester 1884
spezielle Pathologie und Therapie
Joseph von Held
Wintersemester 1882/83 – Sommersemester 1883
allgemeines sowie gemein-deutsches und bayerisches Staatsrecht, Rechtsphilosophie und Völkerrecht
Johannes Wislicenus
Wintersemester 1880/81 – Sommersemester 1882
Chemie
Anton Scholz
Wintersemester 1879/80 – Sommersemester 1880
Exegese des alten Testaments und der biblisch-orientalischen Sprachen
Adolf Fick
Wintersemester 1878/79 – Sommersemester 1879
Physiologie
Carl Risch
Wintersemester 1877/78 – Sommersemester 1878
Strafrecht und Strafprozess
Matthias Lexer
Wintersemester 1876/77 – Sommersemester 1877
deutsche Philologie
Franz Joseph Stein
Wintersemester 1875/76 – Sommersemester 1876
Moral- und Pastoraltheologie
Friedrich Wilhelm Scanzoni von Lichtenfels
Wintersemester 1874/75 – Sommersemester 1875
Geburtshilfe
Carl Edel
Wintersemester 1873/74 – Sommersemester 1874
Kriminalrecht und Kriminalprozeß, Polizeirecht und Polizeiwissenschaft
Carl Risch
Wintersemester 1872/73 – Sommersemester 1873
französische Recht
Julius Sachs
Wintersemester 1871/72 – Sommersemester 1872
Botanik
